本尊者，本有而于出世间为最胜最尊者。大日经本尊三昧品，以本尊之字、印、形三者，各立为二。(一)字之二种：(1)观字义，阿字是菩提心，故即向阿字观自性清净之菩提心。(2)唱阿之声，唱之如铃铎之不绝，以此声调出入之息。

　(二)印形之二种：(1)有形，形者，青黄等色、方圆等形、屈伸坐立之类。印者，所执之印，如金刚杵之类。即初心者先于心外观有形之画尊，藉此以渐入无形。(2)无形，后渐淳熟，又以加持力故，本尊自然显现于心，与心相应，而于心外无缘。

　(三)本尊形之二种：(1)非清净，即初心者初观有相之尊，藉此而渐入无相清净处，然以本尊为有相故，称为非清净。(2)清净，即由有相进入无相清净处，而寂然无相，是为清净。［大日经疏卷二十］