(一)位于福建福清县城西十七公里处。又称南山。以盛产黄檗（其树皮可作药用与染料用）而得名。唐贞元五年（789），正干禅师开山建寺，名般若堂。其后大辟堂宇，历时八年，改称建福寺。旋有希运禅师

住山，黄檗之名顿显，该寺遂成为我国禅宗临济派之大道场，宋时颇为兴盛。其后，历经兴衰。明神宗曾赐以万福禅寺之额。至崇祯十四年（1641），隐元始重兴。后隐元东渡日本，开创宇治大和山，即取其规模，并取名为黄檗山万福禅寺。［景德传灯录卷九、宋高僧传卷二十、释氏稽古略卷三、黄檗山志］（参阅‘万福寺’5545）

　(二)位于江西宜丰县西五十七公里处。又称鹫峰山。唐末，希运禅师至此开山。以其出家于福州黄檗山，故世称此山为黄檗山，寺名黄檗寺，又称灵鹫寺。不久，四方学者望风云集，往来常有千余人。唐宣宗曾幸此山，与希运同观瀑布，并相对赋诗，从此黄檗宗风盛于江南。又希运之后，有法济、志因、惟初、惟胜、道全、永泰等相继住此，山名益着。南宋绍兴九年（1139），高宗曾赐名‘报恩光孝禅寺’，以为追念其父徽宗之所。至明中叶曾废毁，然明思宗时，常愚、昭通等曾复兴之。［黄檗禅师传心法要序、隆兴佛教编年通论卷二十六、佛祖历代通载卷二十三］

　(三)位于江西余干东南四十六公里。又称小庐山。

　(四)为日本黄檗宗之大本山万福寺之山号。（参阅‘万福寺’5545）